Tikessä tehdään aktiivisesti substanssi- ja tilastoalan yhteistyötä kansallisesti ja kansainvälisesti. Kansainvälisesti tärkeimmät yhteistyötahot ovat Eurostat, Komissio, DG AGRI ja FAO sekä yhteistyö puheenjohtajana lähialueiden tilastovirastojen kanssa maataloustilastoinnin Nordic- ja Baltic-Nordic –verkostoissa. Tike toimii Suomen edustajana Komission maataloustilastoinnin pysyvässä komiteassa sekä Tiken tilastojohtaja on valittu vuosiksi 2010-2011 Komitean Partnership Groupin jäseneksi.
Tiken kansallisen yhteistyön keskiössä on maa- ja metsätalousministeriön tehtäväalueen tilastotoimen yhteistyöryhmä. Tiken, ministeriön ja Tilastokeskuksen lisäksi yhteistyöryhmän ja sen alajaostojen toiminnassa ovat mukana Maaseutuvirasto, Elintarviketurvallisuusvirasto, Maanmittauslaitos, Metsäntutkimuslaitos, MTT Taloustutkimus, Riista- ja kalatalouden tutkimuslaitos ja Suomen ympäristökeskus. Yhteistyöryhmä perustettiin keväällä 2007 ja sen tehtäväksi määriteltiin yhteistyön ja koordinoinnin kehittäminen sekä linjausten tekeminen maa- ja metsätalousministeriön tehtäväalueen tilastotoiminnassa.
Tike järjestää säännöllisesti yhteistyöpalavereja ja etujärjestötilaisuuksia, joissa käsitellään asiakkaiden tietotarpeita sekä esitellään uusia tiedonkeruita, tiedonkeruissa tapahtuvia muutoksia, tilastotoiminnan kehittymistä ja tulevaisuuden suuntaviivoja. Keskeisiä yhteistyötahoja ovat MMM, MTT, Mavi, Evira, Vilja-alan yhteistyöryhmä (VYR), MTK, SLC, muut alan etujärjestöt, ProAgria, Luonnonvarat- ja ympäristötutkimuksen Yhteenliittymän ENVDAT-ryhmä ja Tilastokeskus, alan yritykset ja tutkimuslaitokset. Sidosryhmien edustajia kutsutaan laajojen kehittämishankkeiden ulkoisiin ohjausryhmiin.